一、发霉影响防腐木的外观质量：木材的发霉是由于霉菌侵蚀木材而引起的，危害木材的霉菌属于子囊菌纲与半知菌纲的真菌，如木酶属(Trichoderma)、青霉属(Penicillium)和曲霉属(Aspergillus)。不同属别的霉菌的结构形态及其分生孢子的颜色各不相同，因此感染了不同颜色的孢子后在木材表面形成不同颜色的霉斑，如黑、绿、黄红、蓝绿等，影响木材的外观质量。例如曲霉的黑曲霉产生的孢子成黑色，感染这种孢子的木材表面呈黑色，有时也连成一片。一般，各类霉菌引起的变色如下：木霉菌——变绿、镰刀菌——变红或变紫、曲霉菌——变黑、青霉菌——变绿、根霉菌——变黑等。
二、发霉影响防腐木的渗透均匀性：霉菌喜好潮湿的环境，因此没有经过干燥的原木端头、板方材、单板等很容易发霉，尤其是阔叶材的边材部分。木材的发霉通常只限于面层或靠近表面很浅的层，只有在适宜的条件下菌丝才会向内部侵入。菌丝是通过文孔向木材内层侵入的，主要吸收木材内的一些淀粉和糖分等营养物质，对细胞壁几乎没有影响，因此通常发霉对木材的强度没有影响，但是由于纹孔的破坏，所以渗透性有所增强。但是这并非是一个可利用的现象，因为这样引起的渗透性的提高在木材内并不均匀，如果对这样的木材经过防腐处理，经常会发现防腐剂在木材内部的分布不均匀的现象。
三、发霉的木材有利于木腐菌的侵害： 蓝变或发霉的木材往往有利于木腐菌的侵害，所以木材开始发霉、变色时，应进行防腐处理，加强木材的保管。
四， 如果发霉的防腐木经及时防腐，碳化处理还是可以用的。
